Известный специалист по происхождению еврейских фамилий - Александр Бейдер утверждает, что фамилия Натапов происходит от названия реки Черная Натопа (по белоруски она называется Натапа). Река эта протекает по территории бывшей Могилевской губернии, сегодня – Могилевская область Белоруссии.
Надо заметить, что фамилия эта чрезвычайно редкая и, несмотря на столь характерное русское звучание, абсолютно еврейская. Можно с уверенностью сказать, что все Натаповы состоят в родственных связях, причем не столь дальних. Ведь фамилия эта была взята не ранее начала 19 века, когда евреям Российской Империи было предписано взять наследственные семейные имена. То есть другими словами все Натаповы, по всей видимости, имеют общего предка всего каких-то 10-12 поколений назад.